Le secrétaire général du CEPCA a pour rôle :
- Le Secrétaire Général est chargé de la coordination générale de l’action du CEPCA.
- Il veille sur la supervision du Comité Exécutif à la mise en œuvre des décisions prises par l’Assemblée Générale.
- Il est chargé de la gestion et du suivi des activités du CEPCA,
- Il fait appel aux ouvriers à travers les Eglises membres.
- Il coordonne toutes les activités exécutées par les Départements à travers un Comité d’évaluation dont il est le Président.
- Il rend compte de son activité au Comité Exécutif et à l’Assemblée Générale par des rapports d’activités.
- Il est le Secrétaire de séance de l’Assemblée Générale et du Comité Exécutif ;
- Le Secrétaire Général de CEPCA doit être un ecclésiastique.
- Il suit toutes les affaires en contentieux du CEPCA.